在宝石显微镜下观察不同的宝石特征信息对检测祖母绿的充填是非常重要的。在特定的照明方式下出现的闪光效应，就是祖母绿中填充与其折射率接近的物质例如树脂,所呈现的特征信息。扁平气泡的存在或者残余物的改变也是宝石充填的一个线索。在紫外荧光灯下宝石呈现特征荧光颜色如蓝白色或黄绿色是充填物质引起的。傅里叶变换红外光谱计因为获得物质的分子振动数据而有效地检测出宝石是否充填了树脂或油。通过这个方法可以分析整个宝石，并且可以大概的分析出充填物的数量。拉曼光谱有高的分辨率，并在显微镜的放大检测下可以分析出裂隙中充填了物质的具体位置。